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威脅魚類的因素包括失去棲息地、溼地被用於農業和水產養殖、外來物種入侵、氣候變化加劇，以及水電大壩破壞河流及其支流。報告特別強調水電開發是目前最大且仍在不斷增強的威脅，這些開發工程改變了湄公河的流量和水質，對魚類的洄游遷徙造成阻礙。
報告指出，湄公河佔全球內陸漁獲量的15%以上，每年的經濟價值超過110億美元，如果魚類資源枯竭，將損害下游至少4000萬人的糧食安全，並迫使數百萬依賴湄公河為生的人轉向農業，進一步加劇當地的森林砍伐。
湄公河水位下降也對交通物流產生影響，最近越南南部湄公河三角洲地區由於炎熱天氣導致水道乾涸，影響稻穀運輸。
這份報告大力呼籲湄公河流域國家採取行動，努力保護和恢復河流生態系統，包括增加河流的自然流量、改善水質、保護重要的棲息地和物種，以及拆除老舊的河流屏障，以阻止生態浩劫的發生。
