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環團也認為，台電興建深澳的1千億預算，應該投資在更新現有電廠設備、持續開發再生能源，才符合經濟效益。
對此，台電強調，日本磯子電廠是國際能源署（IEA）公認世界第一的高效率低排放燃煤電廠，而台電新深澳計畫就是效法世界第一，使用相同的超超臨界（USC）發電機組，也將比預計2020年商轉的日本竹原燃煤電廠環評承諾排放值更低。
台電指出，台灣正朝永續能源、非核家園邁進，2025年燃氣發電占比將提升至50%，不過，天然氣仰賴進口，安全存量天數較低，為了避免過於仰賴天然氣而遭外國「鎖喉」，仍應保留一定的燃煤機組，避免電力能源與國家的整體安全風險。
至於環團關注能源選項部分，台電也表示，目前電源開發是以再生能源優先，天然氣發電為主，並依據政府能源配比目標保留一定燃煤發電比例，以確保能源多元化及能源供應安全，並非以燃煤作為唯一選項。
