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對此，勞動部次長林三貴表示，移工檢測計畫是彰化縣政府7月24日向勞動部提出，針對移工血清抗體檢測研究案經費補助，目的為針對移工血清武漢肺炎病毒進行的流行病學抽樣研究，提供防疫政策研擬參考。林三貴指出，由於彰化縣政府區域內產業移工密度很高，因此對移工血清抗體檢測，與萬人普篩案不同；勞動部就安基金基於促進國民就業、勞工福祉、移工管理等前題下，8月3日同意彰化縣政府的計畫。
林三貴說，之前彰化縣政府在此計畫會議上並未提及6月標案一事，如未經核定即辦理採購，將待釐清後不排除停止經費補助。他強調，有明確告訴彰化縣政府，只要涉及防疫的部分，都依程序要通報給中央流行疫情指揮中心；另外計畫在審核後也有告知指揮中心。
勞動部表示，根據研究計畫內容，研究樣本僅為1600名，占彰化移工總數約5萬7000名中的2.8%，並非普篩。預計109年度辦理1000名，經費141萬5689元；其餘抽樣的600名及經費預計於110年辦理。勞動部說，據了解，因人力及試劑問題，目前彰化縣政府尚未開始執行計畫；其他縣市也未提出類似計畫需求。
對於勞動部的意見，彰化縣府澄清，標案是由縣府先墊付，等到勞動部、疾管署與哈佛大學的卡介苗試驗計畫補助經費核撥後，再歸墊轉正。
