最終篇的劇情逐漸來到後半部，在本次的劇情中可以觀賞到學生們和老師聯手攻略「阿特拉哈西斯的方舟」的相關故事。同時也推出了包含4個階段地區的BOSS與透過戰鬥占領據點的遊戲內容「阿特拉哈西斯的方舟占領戰」，該部分進行至9月5日維護前，玩家們完成各種任務可獲得「奧秘之書」、「青輝石」等獎勵。
本次更新也推出了新學生「季」與「渚」。首先，隸屬於「千年科學學園」的爆炸攻擊類型前鋒學生「季」，使用「EX技能」時，將轉換至攻擊力、命中數值、閃避數值皆提升的「Abi-Eshuh模式」，並給予直線範圍內的敵人三階段攻擊力比例的傷害，且無視敵人60%的防禦力。「渚」是隸屬於「三一綜合學園」的爆炸攻擊類型特殊學生，「EX技能」可以給予圓形範圍內的敵人攻擊力比例的傷害，若攻擊對象為「輕裝甲」類型，可以在攻擊前15秒減少敵人的防禦力
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