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對於水庫水源檢出阿米巴原蟲，台水說明，阿米巴原蟲廣泛存在於各種環境當中，阿米巴蟲體大小約為10-60 µm，在水中可以視為較大的生物顆粒，透過加藥混凝形成膠羽，因重量及體積變大可沉澱去除，後端的過濾程序設計可濾除大於0.5µm的顆粒，可以被完全去除。
台水指出，目前環保署監控的飲用水質生物性標準為總菌落數及大腸桿菌群，阿米巴原蟲並非檢測項目，大腸桿菌群也是透過淨水處理程序來加以去除，而阿米巴原蟲是大腸桿菌群數十倍大，去除效果更佳，且根據歷年來檢驗結果，自來水水質合格率達99.94%以上，使用安全無虞，請民眾安心使用。
此外，台水也提到，阿米巴原蟲對於熱的反應非常敏感，在溫度50度就失去活性，100度以上數秒內便能完全被殺死，以目前台灣民眾的飲水習慣，通常先將水煮沸再飲用，更可有效防止阿米巴原蟲的危害。
