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指揮中心醫療應變組組長薛瑞元表示，面對任何疑似病患或接觸者，全國北、中、南、東四區，包含疾管署實驗室與各醫院檢驗室，共有34間機構可檢驗每日最大3,800件檢體，目前每天檢驗約1,500件，檢驗能力仍可應付目前狀態。
針對確診病患收治，薛瑞元持續說明，全台共有163間專責採檢院所，所有確診病患必須分流處理，輕症患者由134間應變隔離醫院收治，重症患者則由52間區域與醫療醫院治療。會採取上下轉診治度，如果輕症患者病情加重，能上轉到醫學中心，重症患者症狀減緩則由一般應變醫院接手，維持相互醫療量能。
應變醫院4階段分流 最終非新冠病人全清空
如果台灣新冠疫情不幸擴大，應變醫院分4階段調整病房，第1階段先在負壓或單人隔離式專門收治新冠肺炎患者，假使疫情擴大、感染人數增加，必須將非新冠病人集中收治，空出的病房區專門收治新冠肺炎患者，若疫情再擴大，必須停止收治一般病人，只收治新冠肺炎疑似或確診患者，最後則清空所有非新冠病人。
統計全國專責醫院治療能量，負壓與專責病房共有2,700空床，目前使用床數約41%，如果清空應變醫院病床，還可以增加3,000床，如果疫情非常嚴峻，疫病醫院清空所有床位，預計能有2萬床治療能量。並且，全國呼吸器共約1萬台，當中僅約1,300台可緊急調用，目前努力維修可用的呼吸器約2,200台備用。
集中檢疫所不排除徵調軍營 檢疫住院須分流
同時，醫療與照顧機構的工作人員、航空公司機組人員、美國回溯專案對象，以及清明連假曾到人潮眾多景點的民眾，都是擴大採檢的對象，包含旅遊史與接觸者等，未來採檢等待結果時，有機會將在集中檢疫所。目前共有564床，指揮中心未來不排除徵調軍營等地，當作臨時集中檢疫所使用。
薛瑞元補充說明應變分流機制，住院前，居家隔離／檢驗者，如果需要採檢或住院，或機場採檢確診患者，會優先安排至縣市應變醫院；集中檢疫者會安排至集中檢疫所與負責醫院；擴大採檢或社區監測對象，若需要採檢，會安排到區域檢疫院所。如果需要住院，則會送到非重度收治的隔離醫院。
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