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島上生態豐富，除了春夏季鐵炮百合，秋季金花石蒜，還有神秘的11個基隆值得遊客去探尋，像是從海上欣賞基隆山、基隆港、基隆市及踏上基隆嶼，還可以欣賞七個以基隆為名的植物，基隆蠅子草（瀕危）、基隆筷子芥（瀕危）、基隆早熟禾、基隆短柄草、基隆澤蘭、基隆野山藥、基隆天胡荽。
想去基隆嶼的民眾，只要選定經市府核准登島的船舶，可以在碧砂漁港、八斗子漁港、八尺門漁港及基隆港小艇碼頭等處搭船，每艘船都隨船配有專業導覽解說人員，為登島遊客領隊解說及安全管理。今天登島首日的前100名登島遊客，可另外獲得市府準備的限量紀念品，另外也特別推出「基隆嶼簡介」摺頁供遊客索取。
正式開放後除船費外，為落實永續觀光，市府將另向登島遊客收取100元保育維護費，做為基隆嶼資源保育及環境維護費用，以維持觀光遊憩品質及環境資源保育。另外，配合開放登島，遊客只要憑登島保育維護費票券收執聯於6月底前到碧砂漁港的特約店家即可享有9折優惠。
