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然而針對陳時中下令政風處調查，引發醫界與公衛界的反彈，有50.24%的民眾覺得指揮中心的做法是正確的，因為本就該由中央統籌，這樣可以達到殺雞儆猴的效用；不過只有差距近5%（45.49%）的民眾認為出動政風調查是反應過度。
另外彰化縣衛生局與台大公衛學院合作，進行萬人血清抗體檢測計劃，以了解本土社區感染狀況，同時評估不同暴露條件下的感染風險，還能夠提供疫苗與治療參考方向，但種種事件也多次與中央槓上。對此，有51.61%民眾不支持彰化縣的作法，認為應該還是要聽指揮中心統籌下令，47.34%民眾則覺得如此作法才能知道有無社區感染，因此表達支持立場。
不過原預計在8月25日對外發表萬人血清抗體檢測期中報告結果，卻在前兩天臨時以「行政作業程序不足」為由喊卡，受到各方熱烈關注，對此事有37.05%民眾認為是因為篩檢結果不如一開始的預設、但也有35.06%民眾覺得一定是受到中央打壓才臨時取消、另也有近2成（19.54%）民眾覺得是因為政風處要查，所以退縮了，並有3.46%民眾認為真的是因為行政作業來不及來延後的。
由此民調結果可見，支持彰化縣或支持指揮中心作法的兩方人馬意見相當，比例也差距不大。參與本次《NOWnews今日新聞》線上時事民調共有4216人，由於並非嚴格意義的調查，僅能代表線上網友一部分的意見，相對來說仍有一定程度的參考價值。
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