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究其人事布局的思維，2016年蔡政府上台後，由於不承認「九二共識」，導致兩岸關係緊張，中國不斷打壓我外交生存空間，近期更密集派出共機擾台，成為我國家安全最主要威脅。在國內新冠肺炎疫情於農曆年後趨緩後，國安團隊再度將核心拉回到處理兩岸問題上。
陳明通一向被視為「綠營兩岸通」，由陸委會主委轉任國安局長，借重的就是他的兩岸經驗。2000年，在蔡英文擔任陸委會主委時，陳明通是副主委，後來在2007年以及2016年，陳明通再度回鍋擔任陸委會主委。對於中國對台政策的轉變與研究，學界出身的陳明通私下表示他都有所掌握。
據了解，蔡英文相當信任陳明通，將陳擺在國安局長的位置，可見蔡政府以國安層次的高度緊盯台海情勢發展，以因應對岸對我越來越不友善的態度。黨政人士也說，目前國際肺炎疫情嚴峻，而在此後疫情時代，中國積極擴張勢力、對全球其他國家形成威脅，而陳明通長年研究兩岸情勢，對中國相當了解，所以蔡總統希望借重他的長才，讓他轉任國安會主委。
而新任陸委會主委邱太三，2004年也曾擔任過陸委會副主委，雖然已轉任教職，但是仍跟陸委會密切聯繫，蔡英文邀請邱太三重出江湖，能無縫接軌陸委會事務，期盼能處理棘手的兩岸議題，以及港版國安法實施後的港澳局勢。
知情人士透露，其實早在去年、蔡總統連任之時，就有意想找邱太三回歸政府團隊，但邱當時無心重返政壇、並未首肯，經過一年來的徵詢，邱太三才終於答應接下陸委會主委。
在川普政府執政期間，台美關係堪稱近10多年來最好的時刻，為了抗中，川普任內屢屢宣布對台軍售案，但是美國拜登政府上台後，雖然也把中國視為威脅，但是卻不選擇與中國直接對抗，而是視為競爭夥伴。邱國正接任國防部長傳聞已久，他於1999年從美國陸軍戰爭學院畢業，並在2018年入選該校名人堂，是首位入選的台灣人，熟悉美國的國家戰略和軍事思維，擔任退輔會主委期間，也大力拓展與美國退伍軍人交流。
邱國正接任國防部長，蔡政府將仰賴他熟悉美國國家戰略、軍事思維的專長，配合駐美代表蕭美琴，微調新的對美交往政策，以因應拜登政府上台後美中關係的轉變。
