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據連江縣戶外與海洋教育中心所述，藍眼淚實為屬於甲藻門單細胞生物的夜光藻（Noctiluca scintillans），又稱夜光蟲，是種在海中生存的非寄生甲藻，藍色螢光便是生物自體發光所致。該種藻類之所以能發光，原因是體內含有螢光素-螢光素酶，使其感受到周遭環境的變化時發出螢光。
「馬祖藍眼淚」爆紅起因
講到藍眼淚奇景，不得不提享譽國際的「馬祖藍眼淚」，起初是外國攝影師安德列歐（Rogelio Bernal Andreo）2015年在南竿五五據點拍下一張以銀河為背景的藍眼淚，意外成為美國國家航空暨太空總署（NASA）官網「每日一天文圖（Astronomy Picture of the Day）」的選圖，自此聲名大噪，每年吸引數十萬遊客前往。
觀賞「馬祖藍眼淚」的最佳時機
藍眼淚通常在每年4至6月出現、9至10月消失。4至6月適逢閩江氾濫期，豐富的營養物質會吸引夜光蟲跟著海流聚集至馬祖沿岸，又因他們是浮游生物，數量多時，白天會在海上會觀察到一片褐色線條樣貌的「赤潮」，若有幸在白日看見此景，就能大大增加晚上看到藍眼淚的機會。
