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而低收入戶、中低收入者、身心障礙者不論就醫醫院層級別，均維持藥費100元以下免收取費用，101元以上收取20％費用、最高收取200元。
在急診部分負擔，基層診所與地區醫院維持150元，區域醫院調升為400元，醫學中心調升至750元。
另外，在慢箋部分負擔方面，基層診所，無論中醫、西醫，3次調劑免收；地區醫院、區域醫院、醫學中心首次調劑比照一般箋，第2次以後免收。
健保部分負擔新制上路首日，石崇良親自率隊前往台北市聯醫（仁愛院區）及馬偕醫院視察醫院資訊系統調整狀況，並實地瞭解民眾就醫流程及實際感受，他表示，調整目的是希望民眾有分級醫療與費用意識，共同珍惜健保醫療資源，且透過各級醫療院所的分工合作，病人更能獲得優良的醫療照顧，盼新制上路流程順暢。
在行程中，石崇良接受媒體聯訪指出，視察重點主要分成對民眾宣導是否落實，與收費系統是否順暢兩大塊，談及視察過程中，有民眾當面反映「不清楚新制」，以及抱怨「藥費變貴了」，他強調新制調整是希望「落實分級醫療」，讓重症或急症患者能得到多一些醫療資源挹注，而穩定的慢性病人則就近在基層診所看醫生，故基層醫療的收費都沒有增加。
