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國民黨立委馬文君近期接獲投訴，「校園流感電子化系統」疑似出現嚴重資安問題，某校護理師可以看見不同區、同校名的學校計畫與資料，若遭有心人士利用、搜集個人資訊並加以處理及濫用，將導致人格權遭受侵害，也等於將個人醫療資訊完全公開。
對於相關情況，疾管署說明，CIVS系統使用者帳號設計上，一間學校就是對應一個代碼，與校名重複與否無關，每間學校人員也只能看見自己學校的資訊，立委所提案件經瞭解，是因為誤植護理師的學校代碼，9月15日已經進行修正，目前釐清此為單一事件，疾管署也已經致電表達歉意。
至於廠商兩度出包、疾管署是否會加以咎責，疾管署副署長曾淑慧接受《NOWnews今日新聞》電訪時表示，第一時間的重點是釐清案情、了解是否有其他類似情況出現，目前已確認這次事件屬個案，但也請同仁與廠商對系統再三檢查、確認，後續會對廠商進行處置，但目前還沒有明確方向。
