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陳君愷表示，在現代戰爭瞬息萬變的情況下，一個口令一個動作的機械式軍事訓練，已不能應付時代所需；要能在現代戰場上存活且獲勝，端賴軍人獨立作戰的能力。故而我們應該培養軍人獨立思考的能力、並賦予軍官擁有質疑上級命令的權利，如此一來，又豈會有軍隊向民眾開槍的疑慮？
針對國防部長邱國正昨日一席「建（黑熊學院）這種部隊會變成游擊隊」的誇張評論，陳君愷痛批邱國正因循苟且、不學無術，與丘八無異。
陳君愷指出，黑熊學院的宗旨和台灣基進的倡議，一直都是要催促政府加速防衛準備。面對台海局勢的嚴峻挑戰，國防部總是顯得被動，且嚴重準備不足，令人憂心。從海島防禦的角度看，台灣理應要在海空封鎖、以及飛彈飽和攻擊的狀況下，讓社會能夠維持正常運作，伺機尋求勝利的機會；而這需要通盤檢討整體架構、徹底重構兵役制度、以及真正建立起全民國防，才有可能達成。
陳君愷反嗆，「國防部長一席話，不知是刻意要貶抑黑熊學院及眾多關心民防的有志之士，還是單純和馬文君一樣無知？」
