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蔡以父母年邁，母親罹患類風濕性關節炎，需專人照顧，以「侍親」為由，申請2019年5月至8月31日止留職停薪。
但蔡在留停期間，於5月27日偕妻陳玉玲，在金門秀中預拌混擬土廠，協助陳玉玲家族所經營「海瑞營造」所承攬位於烏坵島之軍方營舍興建工程。
又於6月28日偕同陳玉玲，協助海瑞營造承租工程用的吊貨車，另自同年7月1日起協助監督海瑞營造得營舍工程的興建。內政部認為，蔡其豪有《公務員懲戒法》非執行職務之違法行為，致嚴重損害政府之信譽，移送懲戒法院審理。
懲戒法院根據監察院調查、金門縣警局的調查報告，認為蔡其豪申請留停期間所從事的行為，與請假的目的相去甚遠、與兼職無異，也未得任職機關的同意或備查；另外，在督察科調查時，不實陳述到烏坵散心，探親找配偶，順便與配偶一起返台。
但調查發現，蔡登島期間，妻子並未在烏坵島，蔡登島的目的，是協助監督海瑞營造的興建工程。
懲戒法院審酌，蔡不思以身作則為部屬的表率，而反覆從事與申請留停事由不符的行為，並衍生糾紛，嚴重損害政府信譽，事發後接受調查，又做不實陳述，判決記過2次。
