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孕婦及青少女等特殊族群對於施打疫苗仍有許多不安和疑慮,主要是受到一些誤解及迷思的影響。其中,青少女主要在人類乳突狀病毒(HPV)疫苗;而孕婦的部分則相對廣泛,包括流感疫苗、百日咳疫苗等。至於國一入學青少女接受公費人類乳突狀病毒(HPV)疫苗施打,民眾的疑慮主要來自網路關於後遺症及副作用的報導;蔡幸芬醫師指出,少數施打HPV疫苗後死亡的個案皆證實非與疫苗直接相關,懷疑後遺症的部分經追蹤亦大多與疫苗無直接相關證據,且2017年世界衛生組織WHO也發表文章支持疫苗的安全性,目前並無明顯的疑慮。
蔡幸芬醫師表示,研究顯示人類乳突狀病毒(HPV)與子宮頸癌及癌前病變有高度相關性,截至2014年,子宮頸癌仍名列台灣女性10大癌症的第8位,可藉由施打疫苗加強自體免疫清除HPV,降低遭受感染後發生子宮頸癌及癌前病變的機會,更減少因患病導致個人與家庭負擔以及醫療照護的花費。因此,她建議青少女在專業醫師評估後接受HPV疫苗施打,且在開始有性行為後定期追蹤子宮頸抹片,以期能提升子宮頸癌的預防和照護。