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工會指控，長榮航空已逼工會退讓，卻在簽約時堅持秋後算帳，不惜罔顧法律，不顧旅客權益，只為打壓罷工，消滅工會的舉動，工會唯有繼續罷工，並開始向會員收取三寶切結書，展現更強烈的意志與團結。
此外，工會 6 月 20 日宣布罷工行動開始，下午 4 時後報到的勤務，均不得提供勞務，但有 18 名空服員於下午 4 時前報到，卻在飛機起飛前一刻才宣布罷工，長榮航空認為她們擅離職守，嚴重違反公司規定，先暫記曠職。工會強調，遭記曠職 18 人均於下午 4 點停止勞務，合法性完全無虞。
工會另外爆料，罷工期間遭記曠職懲處的會員總人數達 25 人。除上述 18 名空服員外，另有 6 月 20 日執行地面訓練勤務，同樣於下午 4 點後，當面告知主管表示必須去參與罷工行動，事後被記曠職，以及某會員配合工會參加罷工活動，但 6 月 22 日 BR196 勤務遭改曠職。
長榮航空回應，有 7 名空服員接受地面機型轉換教育課程，在課程進行當中離開參加罷工，公司已經先將他們暫記曠職，將進一步調查後進行懲處。至於 6 月 20 日在服勤時間擅離職守的 18 位空服員，目前已經有 3 名在 6 月 28 日取回三寶，公司已將他們加入排班。但這不影響其6月20日暫記曠職，以及日後進行調查後，進行懲處。
