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陳時中表示，昨（3）日晚間武漢台胞班機到達台灣後，先進到維修棚內，完全與外界隔離，等到民眾陸續下機後，馬上就替他們換上隔離衣，並開始做發燒篩檢等一連串的健康評估，由於人數眾多，此流程一路從3日晚間11時進行到4日凌晨3時左右才結束，之後陸續將台胞送往北部、中部等各處的檢疫所；而這些台胞所有行李都由國軍化學兵進行消毒，並經過X光掃描，最後也順利通過關務人員的檢查。
陳時中說道，他等到凌晨3時所有檢查完成，又一路跟著69名台胞一同到中部檢疫所，約凌晨5時到達中部，在當地進行量耳溫等檢測工作，並宣導隔離期間須知，等到所有安置措施都完成時，已經約凌晨6時左右；同時，國軍化學兵也在約凌晨6時20分左右，完成所有樓層與台胞經過路線的消毒工作。
「階段性工作已經完成。」陳時中從3日晚間到達機場後，緊盯檢疫程序，直到武漢台商抵台後仍不敢大意，還一路跟著69位台胞到達中部檢疫所，最後直到4日凌晨6時左右才完成所有程序，接著又返回台北疾管署召開記者會，幾乎超過24小時未闔眼，在早上說明包機情況時，還一頓對時間序感到錯亂，隨後也向現場媒體坦言「我剛剛才（從中部）回來，頭腦有點灰灰（台語，意為模糊）」。
陳時中雖然整晚沒睡，但他最心疼的還是第一線人員。他說，看到6位隨車醫護人員從昨晚9時30分穿上隔離衣後，就一路忙碌到凌晨5時，這期間「一口水都沒喝」，最後累到幾乎是「腰都彎了」。但他也強調，所有工作人員對於能完成這項艱鉅任務，都感到相當光榮。
