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遠航目前有8架MD客機，其中2架機齡已達26年，另有2架機齡明年元旦也將達到26年。為了淘汰舊飛機，遠航在去年引進2架ATR72螺旋槳客機，今年10月再引進1架ATR72-600客機，預計明年上半年再引進3架ATR72客機，同時規畫在2019年引進波音737MAX客機，成為台灣首家宣布引進737MAX客機的航空公司。
2014年9月16日，「同心26號」演習配合「漢光30號演習」實施後備部隊機動部署，國防部徵用遠東航空、復興航空班機，當天上午9時陸續自高雄小港機場升空，搭配4架空軍C-130運輸機，在特定空域集結編隊後，由戰機護航，輸送這一個營兵力至澎湖，模擬投入戰場。這也是漢光演習首度徵用民航機，將前運納入驗證科目，提升演習整體效能。
▲2014年漢光演習期間，國防部曾徵用遠東航空MD客機運送後備部隊至澎湖。（圖／軍聞社提供）