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中科院強調，有特定媒體多次報導中科院受國防部委託的科研專案，這些專案均是被核定為機密的國防資訊，任何有意透過管道刺探且公開報導，均可能涉及違反國家機密保護相關規範，若經查涉及洩漏機密且造成傷害，將依法辦理。
在1996年台海飛彈危機之後，中科院開始專案研發具備飛彈攔截能力的天弓三型防空飛彈，弓三飛彈最大射程200公里，發射系統包含飛彈、發射架、戰術中心、相列雷達、電源車與通信中繼車。中科院表示，弓三飛彈採單節固態火箭垂直發射，每具弓三發射架可承載四具彈箱，可由戰術中心遙控操作，可裝填天弓三型或天弓二型飛彈。
由於鷹式（HAWK）防空飛彈服役近一甲子，美國生產線早已經關閉，儘管經過升級，但是礙於零配件取得不易，因此國防部預計在2020年前讓所有的鷹式飛彈退役，改由天弓三型防空飛彈取代。
