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三總澎湖分院院長施宇隆表示，對於大量傷患演練，都是澎湖分院每年演習的重要目標。不但會進行桌上演練，也會實際演練。不管是陸上或海上的傷患，都隨時有足夠的人力支援。醫院前停機坪就是為空中緊急後送病患，讓直升機能夠直接降落，再後送到台灣本島。
澎湖四周環海，漁業與潛水是澎湖重要產業，三總澎湖分院也具備治療潛水伕症的大型高壓氧設備，是全國軍醫院中第三個具備大型高壓氧設備，如果是在做減壓症治療的情況下，將會在上升到60呎的時候開始戴上氧氣面罩，利用氧氣把身體內部的惰性氣體排泄出去，改善潛水伕病的症狀發生。院方表示，預計今年底汰舊換新，引進預算2000餘萬元之「多人高壓氧艙」，以造福更多澎湖軍民。高壓氧設備除了應對離島較少見的一氧化碳中毒之外，更對於操練備戰的水下作業大隊或潛艦官兵具有救命重要療效。
三軍澎湖分院成為離島指標性醫院，院方表示，今年4月完成離島首例開心手術，更持續積極落實醫療在地化，近5年已投入2億多元採購醫療器材，後送人數也從每年5000多例降到2000例，守護離島軍民健康。
