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不過，李秉穎今（31）日在臉書分享退休訊息，提到今天是他當公務員的最後一天，明天就要退休，他也貼出從台大醫學院長倪衍玄手中、接下退休紀念品的照片，衛福部次長、曾任中央流行疫情指揮中心指揮官的王必勝也在貼文下留言表示，「感謝您對防疫的貢獻，也給我們很多指導！」
外界開始熟悉李秉穎，或許是從新冠肺炎疫情3年間、中央流行疫情指揮中心的直播影片開始，面對突如其來的百年大疫，民眾惶惶不安、假訊息滿天飛之際，李秉穎總是穿著一身乾淨的素色襯衫、套上指揮中心的灰色背心，以專家之姿、從容地解決各方疑惑，以專業與科學終止錯誤訊息傳遞，因此一度又被稱為「國民公衛導師」。
在2023年初、指揮中心最終場記者會中，李秉穎也現身出席活動，當天的他一改疫情間的嚴肅表情，發自內心露出笑容，同樣一身專屬於指揮中心的打扮，臉上卻揚起大大的微笑，此時面對鏡頭的李秉穎顯得有些俏皮、那份拒人於千里外的氣場消失無蹤，變回那位診間裡充滿耐心與親和力的「李醫師」。
不過，即使在疫情後，新冠肺炎、流感、各類呼吸道傳染疾病的威脅接踵而來，李秉穎仍活躍於媒體鏡頭，多次評論疫情、提供專業的疾病資訊，並持續向民眾宣導疫苗接種的重要性。
對李秉穎來說，推動兒童疫苗接種，似乎是從醫生涯中最重要的工作。即使在選舉期間、候選人大開政治支票，李秉穎先關注的，還是孩子們的權益，更大開專家氣場、犀利批評，大家都拼命在討好「有選票的」，兒童的權利常常被擺一邊，比如醫界爭取多年、對孩子極為重要的兒童輪狀疫苗，到現在都還沒有下文。
李秉穎34年來致力於疫苗接種推廣，更曾自信喊出「兒科醫師最懂疫苗」，在鏡頭前始終堅守專家立場、直言提出建議，但只要回到診間或日常生活，就會變回「孩子們的李醫師」，用充滿親和力與幾分俏皮的笑容，笑看外界紛擾、從來不忘要幫孩子們抵抗疾病的初衷。
