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不過交大資工系教授吳毅成所率領的團隊，發展出CGI程式（全名: CGI Go Intelligence），打破此屏障。在義大利國際IEEE FUZZ會議舉辦的人機圍棋賽中，CGI與紅面棋王周俊勳對弈兩場，CGI先是執黑獲得中押勝，執白也以2.5目獲勝。這是全世界第一次學界圍棋程式在正式比賽的場合中，擊敗職業九段棋士。
CGI程式於六月中在大陸福州舉辦的中韓台人機配對賽，初試啼聲即獲得冠軍；與美女棋士黑嘉嘉的配對組，更戰勝韓國獲數十次世界冠軍頭銜李昌鎬九段的配對組、中國第一位獲得世界冠軍頭銜馬曉春九段的配對組。當時黑嘉嘉讚許「搭檔算得很準，自己下起棋來很放心。」當時CGI被評估大約有職業四、五段棋力，不到一個月的時間，最近受邀到韓國的棋城網站與職業高段棋士對弈，竟然連連擊敗許多高手，勝率達70%。
吳毅成表示，對於CGI程式的表現感到驚喜，兩年前剛開始發展圍棋程式時，在IEEE國際會議所舉辦的人機圍棋賽中，周俊勳讓六子，CGI程式還輸棋。隨後AlphaGo程式的出現，激起團隊的鬥志；在獲得科技部前瞻深度學習計畫、Nvidia支持下；吳廸融等學生改良了深度學習方法，幫助程式大幅提升了棋力。雖然目前CGI程式仍與AlphaGo有一大段差距，除了持續爭取計算資源外，也將發展更多新的方法，來彌補資源不足問題。
吳毅成表示，CGI程式是本土發展的程式，樂見與台灣職業棋士多交流，此外，過去電腦遊戲研究常被譽為研究人工智慧的縮影，現代圍棋程式即採用了許多人工智慧、機器學習方法，因此研究圍棋程式等同探索最新的人工智慧、機器學習方法，未來可應用於許多問題上，如電力節能、機器人、醫療等。
