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一、休息日出勤之工時及工資之計算改依勞工實際出勤時間計算，使雇主指派勞工於休息日工作回歸實際需求，至其工作之時間，仍計入每月加班時數上限。
二、各界對於加班時數多有應允勞雇協商彈性空間之建議，惟修法建議不一。經綜整大多數意見，擬具甲乙兩案，在符合「雇主經工會同意，如事業單位無工會者經勞資會議同意」之程序後，得為以下之調整；另雇主僱用勞工人數在30人以上者，並應報當地主管機關備查：
甲案：得將1個月加班時數上限適度放寬為54小時。
乙案：加班時數得以3個月為周期，單月得運用之加班時數上限適度放寬為54小時，惟3個月之加班總時數仍不得超過138小時。
三、現行輪班制勞工更換班次至少應間隔11小時休息時間之規定，對於勞工身心健康當有助益，惟如一體施行，恐將衝擊現有採行三班制方式輪班之產業。經考量實務運作情形，擬具甲乙兩案如下：
甲案：以給予連續8小時之休息時間為原則；但雇主經工會同意，如事業單位無工會者經勞資會議同意後，得另約定超過連續8小時之休息時間。
乙案：仍以給予連續11小時之休息時間為原則；但雇主經工會同意，如事業單位無工會者經勞資會議同意，得另約定給予適當之休息時間，惟不得少於連續8小時，至雇主僱用勞工人數在30人以上者，並應報當地主管機關備查。
四、例假安排，除實施4周彈性工時之事業單位仍按其原適用之規定外，雇主經工會同意，如事業單位無工會者經勞資會議同意，例假得於每7日之周期內調整；另雇主僱用勞工人數在30人以上者，並應報當地主管機關備查，以符合勞工調整例假以形成連假之需求，並兼顧雇主因應人力調度適度調整例假之需要。
五、年度終結之未休之特別休假日數，得經勞資雙方協商遞延至次年實施，以符合特別休假以休憩之目的，惟為確保勞工特別休假權益不因遞延致減損，次年度終結或契約終止時，經遞延但未休畢之特別休假，雇主仍應發給工資。
勞動部強調，本次修正草案係為使勞雇雙方有適度協商調整之空間，有助周休二日新制等規定進一步落實，以建構符合當前社會與經濟發展所需，並兼顧安全彈性之勞動制度。各界對於本草案內容有任何意見或修正建議者，得於106年11月7日前提供勞動部研參。
