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許能通指出，在憲法的設計當中，立法權制衡行政權是很基本的精神，但明明是掌握行政大權的總統，卻不必去立法院出席報告，只有行政院長才有對國會負責的義務，就會造成有權而無責、無權而有責，也就是決定政策的總統不必對立法院負責，但執行政策卻無決定政策權的行政院長，卻要到立法院護航不一定是自己力推的政策，自然會支支吾吾，無法得心應手。更嚴重的是，實際上要推行這個政策的總統，如果那個政策出了甚麼問題，最簡單的方式就是撤換行政院長，反正政策已經推行，就讓被下台的行政院長負責就可以，總統永遠不會被立法權所監督制衡，造成總統有權無責的現象，並不是合理的憲政體制中所應有的狀況。
對是否支持台灣修憲？許能通的主張是支持修憲，只是現在的修憲門檻很高，如果社會沒有一定的共識，貿然推行修憲可能只會無疾而終，進而消耗民間推行修憲的能量，對於改善憲政體制不見得是好事。
許能通認為，修憲後的制度，其實是偏向總統制的，且總統在台灣人民心中本來就是掌握所有行政權的首長，因此，仿效美國的總統制，應該是比較符合人民對於憲政體制的想像，讓總統可以在憲法上與實際上都是政策的負責人，進而可以要求總統對國會負責，改善有權而無責的狀況，令立法權能夠制衡行政權，落實三權（五權）分立的精神。
