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關島最主要軍事基地為安德森空軍基地（Andersen Air Force Base）。在越戰中，安德森空軍基地扮演作戰與後勤支援重要地位。現為美國太平洋空軍第36聯隊的屯駐地，基地內部署有B-1B、B-52H轟炸機、F-15戰機、F-22隱形戰機等，成為美軍戰略部隊打擊中國大陸與北韓的前線基地。另外，日本航空自衛隊也經常派遣戰機到關島參與演習。
隨著沖繩民眾要求美軍搬離聲浪高漲，1996年美日兩國達成協議，計劃將駐紮沖繩的8000名海軍陸戰隊員，由沖繩移防至關島，但是日本政府也必須負擔1/3的搬遷費用，大約60.9億美元。2010年，美國斥資126億美元對關島軍事設施進行擴建，意將其建成西太平洋超級軍事基地，建設能夠停泊航空母艦碼頭、飛彈防禦設施等。
日前飛越朝鮮半島上空的B-1B轟炸機便來自關島，引起北韓不滿，放話射飛彈攻擊。針對北韓放話攻擊關島，美國也不是沒有防禦手段。當衛星偵測到北韓為飛彈灌注燃料，或是飛彈推進器產生的火焰後，美軍與南韓部隊可對北韓飛彈設備發動先發制人攻擊，美軍日前公布成功發射義勇兵洲際飛彈訊息，警告北韓意味十分濃厚。
一旦飛彈升空後，美國也可啟動「終端高空區域防禦系統」（THAAD，又稱為薩德）、海軍神盾艦標準三型飛彈與愛國者飛彈加以攔截。
