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隨後，防檢局21日澄清，本次合作是《科學人》主動邀約，內容也均由《科學人》撰寫製作，防檢局僅提供相關法規及客觀資訊。陳吉仲同日也說，防檢局之所以在科學人投放廣編，是因為近期有大量假消息在網路流傳；為了避免不實謠言造成消費者的錯誤認知及傷害台灣養豬產業，防檢局才提供正確的資訊希望網路媒體刊登，以保護台灣豬產業不受假消息所害。
政府投放廣告以進行政策宣傳，此事行之有年。不過，本次「科學人事件」會引發各界議論，首先即是《科學人》社群所發布的「萊克多巴胺可增加收益又環保」、「萊豬不好吃」等文字，太過「煽火」；二來則是農委會投放廣告後，也未盡審查責任，放任這些不實文字在輿論中流傳，事後要澄清，卻已為時已晚。
此事件首當其衝就是傷害到《科學人》以往專業、正向的形象，就算是事件已過2至3日的今天，在其粉絲團上仍可見到網友無情地嘲諷。再來，農委會受到「瘦肉精美豬」開放進口影響，已被各界批得體無完膚，原本好意是要花錢為自己洗白，卻又再出包讓輿論更加延燒，最後雖大動作出動防檢局官方、陳吉仲本人出面駁斥，但也難以挽回民心了。
農委會以公帑為自己形象「擦脂抹粉」，是屬於政府行之有年的做法之一。不過，在「美國萊豬」議題仍持續延燒的當下，立即投入資源在投放廣告上，能否達到澄清的作用仍不可知，還可能只會意外觸發民眾更多怒火。
尤其在社群媒體當道的現代，公部門如何有效透過臉書粉絲專頁行銷，還需多加揣摩民意，可以多看看其他部會是如何行銷，不是一味地投放廣告，就會立即為自己形象加分，有時也宛如把一袋零錢奮力投進水裡，獲得的僅是滿身濕。
